Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27aP62983 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms