Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps3P62908 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps3P62908 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps3P62908 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps3P62908 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps3P62908 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps3P62908 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps3P62908 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps3P62908 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps3P62908 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps3P62908 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps3P62908 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps3P62908 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps3P62908 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms