Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra1P62812 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms