Protein–RNA interactions for Protein: P62492

Rab11a, Ras-related protein Rab-11A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11aP62492 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab11aP62492 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms