Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tbpl1P62340 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms