Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copz1P61924 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copz1P61924 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copz1P61924 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Copz1P61924 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copz1P61924 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copz1P61924 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copz1P61924 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms