Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf13P61216 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf13P61216 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf13P61216 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf13P61216 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf13P61216 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf13P61216 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf13P61216 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms