Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcbp1P60335 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcbp1P60335 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcbp1P60335 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcbp1P60335 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcbp1P60335 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcbp1P60335 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcbp1P60335 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcbp1P60335 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcbp1P60335 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcbp1P60335 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcbp1P60335 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcbp1P60335 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcbp1P60335 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcbp1P60335 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcbp1P60335 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcbp1P60335 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcbp1P60335 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcbp1P60335 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcbp1P60335 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcbp1P60335 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcbp1P60335 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcbp1P60335 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcbp1P60335 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcbp1P60335 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcbp1P60335 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcbp1P60335 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms