Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcmtd1P59913 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms