Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Csrnp3P59055 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Csrnp3P59055 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Csrnp3P59055 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Csrnp3P59055 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Csrnp3P59055 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Csrnp3P59055 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Csrnp3P59055 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Csrnp3P59055 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Csrnp3P59055 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Csrnp3P59055 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Csrnp3P59055 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Csrnp3P59055 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Csrnp3P59055 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Csrnp3P59055 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Csrnp3P59055 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Csrnp3P59055 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Csrnp3P59055 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Csrnp3P59055 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Csrnp3P59055 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Csrnp3P59055 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Csrnp3P59055 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Csrnp3P59055 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Csrnp3P59055 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Csrnp3P59055 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Csrnp3P59055 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Csrnp3P59055 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Csrnp3P59055 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Csrnp3P59055 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Csrnp3P59055 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms