Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpm2P58774 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms