Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P58686 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P58686 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P58686 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P58686 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P58686 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P58686 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P58686 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P58686 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P58686 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P58686 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P58686 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P58686 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P58686 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P58686 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P58686 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P58686 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P58686 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P58686 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P58686 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P58686 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P58686 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P58686 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P58686 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P58686 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P58686 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P58686 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P58686 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P58686 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P58686 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P58686 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P58686 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P58686 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P58686 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P58686 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P58686 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P58686 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P58686 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P58686 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P58686 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P58686 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P58686 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P58686 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P58686 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P58686 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P58686 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P58686 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P58686 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P58686 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P58686 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P58686 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P58686 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P58686 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P58686 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P58686 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P58686 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P58686 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P58686 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P58686 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P58686 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P58686 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P58686 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P58686 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P58686 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P58686 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P58686 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P58686 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P58686 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P58686 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P58686 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P58686 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P58686 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P58686 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P58686 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P58686 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P58686 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P58686 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P58686 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P58686 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P58686 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P58686 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P58686 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P58686 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P58686 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P58686 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P58686 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P58686 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P58686 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P58686 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P58686 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P58686 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P58686 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P58686 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P58686 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P58686 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P58686 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P58686 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P58686 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P58686 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P58686 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms