Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms