Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Samsn1P57725 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Samsn1P57725 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Samsn1P57725 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Samsn1P57725 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Samsn1P57725 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Samsn1P57725 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Samsn1P57725 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Samsn1P57725 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Samsn1P57725 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samsn1P57725 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samsn1P57725 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samsn1P57725 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samsn1P57725 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samsn1P57725 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Samsn1P57725 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Samsn1P57725 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samsn1P57725 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samsn1P57725 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Samsn1P57725 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Samsn1P57725 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samsn1P57725 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Samsn1P57725 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samsn1P57725 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samsn1P57725 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samsn1P57725 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samsn1P57725 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Samsn1P57725 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Samsn1P57725 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Samsn1P57725 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Samsn1P57725 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Samsn1P57725 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Samsn1P57725 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Samsn1P57725 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Samsn1P57725 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Samsn1P57725 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Samsn1P57725 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Samsn1P57725 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms