Protein–RNA interactions for Protein: P56960

Exosc10, Exosome component 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc10P56960 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Exosc10P56960 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms