Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf5P56477 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf5P56477 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf5P56477 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms