Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CdaP56389 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CdaP56389 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CdaP56389 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CdaP56389 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CdaP56389 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CdaP56389 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CdaP56389 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CdaP56389 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CdaP56389 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CdaP56389 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CdaP56389 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CdaP56389 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CdaP56389 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CdaP56389 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CdaP56389 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CdaP56389 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CdaP56389 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CdaP56389 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CdaP56389 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CdaP56389 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CdaP56389 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CdaP56389 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CdaP56389 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CdaP56389 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CdaP56389 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CdaP56389 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CdaP56389 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CdaP56389 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CdaP56389 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CdaP56389 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CdaP56389 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CdaP56389 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CdaP56389 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CdaP56389 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CdaP56389 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CdaP56389 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CdaP56389 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CdaP56389 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CdaP56389 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CdaP56389 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CdaP56389 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CdaP56389 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CdaP56389 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CdaP56389 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CdaP56389 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CdaP56389 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CdaP56389 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CdaP56389 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CdaP56389 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CdaP56389 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CdaP56389 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CdaP56389 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CdaP56389 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CdaP56389 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CdaP56389 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CdaP56389 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CdaP56389 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CdaP56389 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CdaP56389 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CdaP56389 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CdaP56389 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CdaP56389 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CdaP56389 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CdaP56389 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CdaP56389 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CdaP56389 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CdaP56389 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CdaP56389 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CdaP56389 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CdaP56389 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CdaP56389 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CdaP56389 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CdaP56389 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CdaP56389 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CdaP56389 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CdaP56389 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CdaP56389 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CdaP56389 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CdaP56389 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CdaP56389 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CdaP56389 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CdaP56389 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CdaP56389 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CdaP56389 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CdaP56389 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CdaP56389 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CdaP56389 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CdaP56389 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CdaP56389 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CdaP56389 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CdaP56389 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CdaP56389 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CdaP56389 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CdaP56389 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CdaP56389 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CdaP56389 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CdaP56389 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CdaP56389 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CdaP56389 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms