Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1P55194 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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