Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pex2P55098 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pex2P55098 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pex2P55098 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pex2P55098 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pex2P55098 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pex2P55098 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pex2P55098 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pex2P55098 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pex2P55098 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pex2P55098 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pex2P55098 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pex2P55098 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms