Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Acod1P54987 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acod1P54987 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acod1P54987 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acod1P54987 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acod1P54987 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acod1P54987 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acod1P54987 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acod1P54987 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acod1P54987 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acod1P54987 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acod1P54987 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acod1P54987 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms