Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad23bP54728 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms