Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacnb3P54285 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms