Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Upp1P52624 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Upp1P52624 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Upp1P52624 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Upp1P52624 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Upp1P52624 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Upp1P52624 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Upp1P52624 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Upp1P52624 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Upp1P52624 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms