Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1cP52432 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms