Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccr5P51682 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms