Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XpcP51612 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XpcP51612 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XpcP51612 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XpcP51612 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XpcP51612 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XpcP51612 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XpcP51612 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XpcP51612 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
XpcP51612 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XpcP51612 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XpcP51612 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XpcP51612 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XpcP51612 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XpcP51612 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XpcP51612 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XpcP51612 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XpcP51612 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XpcP51612 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XpcP51612 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
XpcP51612 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XpcP51612 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XpcP51612 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XpcP51612 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XpcP51612 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XpcP51612 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XpcP51612 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XpcP51612 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XpcP51612 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XpcP51612 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XpcP51612 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XpcP51612 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XpcP51612 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XpcP51612 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XpcP51612 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XpcP51612 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XpcP51612 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
XpcP51612 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XpcP51612 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XpcP51612 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XpcP51612 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XpcP51612 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XpcP51612 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XpcP51612 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XpcP51612 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XpcP51612 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XpcP51612 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XpcP51612 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XpcP51612 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XpcP51612 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XpcP51612 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XpcP51612 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XpcP51612 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XpcP51612 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
XpcP51612 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XpcP51612 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XpcP51612 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XpcP51612 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XpcP51612 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XpcP51612 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XpcP51612 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XpcP51612 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XpcP51612 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XpcP51612 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XpcP51612 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
XpcP51612 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XpcP51612 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
XpcP51612 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XpcP51612 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XpcP51612 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XpcP51612 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XpcP51612 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XpcP51612 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XpcP51612 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XpcP51612 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XpcP51612 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XpcP51612 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XpcP51612 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XpcP51612 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
XpcP51612 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XpcP51612 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XpcP51612 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
XpcP51612 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XpcP51612 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XpcP51612 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XpcP51612 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XpcP51612 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XpcP51612 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XpcP51612 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
XpcP51612 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XpcP51612 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XpcP51612 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XpcP51612 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XpcP51612 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
XpcP51612 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XpcP51612 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XpcP51612 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XpcP51612 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XpcP51612 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XpcP51612 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms