Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TspoP50637 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TspoP50637 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TspoP50637 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TspoP50637 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TspoP50637 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TspoP50637 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TspoP50637 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TspoP50637 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TspoP50637 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TspoP50637 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TspoP50637 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TspoP50637 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TspoP50637 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TspoP50637 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TspoP50637 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TspoP50637 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TspoP50637 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TspoP50637 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TspoP50637 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TspoP50637 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TspoP50637 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TspoP50637 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TspoP50637 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TspoP50637 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TspoP50637 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TspoP50637 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TspoP50637 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TspoP50637 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TspoP50637 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TspoP50637 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TspoP50637 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TspoP50637 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TspoP50637 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TspoP50637 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TspoP50637 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TspoP50637 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TspoP50637 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TspoP50637 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TspoP50637 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TspoP50637 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TspoP50637 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TspoP50637 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TspoP50637 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TspoP50637 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TspoP50637 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TspoP50637 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TspoP50637 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TspoP50637 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TspoP50637 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TspoP50637 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TspoP50637 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TspoP50637 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TspoP50637 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TspoP50637 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TspoP50637 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TspoP50637 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TspoP50637 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TspoP50637 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TspoP50637 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TspoP50637 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TspoP50637 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TspoP50637 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TspoP50637 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TspoP50637 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TspoP50637 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TspoP50637 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TspoP50637 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TspoP50637 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TspoP50637 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TspoP50637 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TspoP50637 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TspoP50637 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TspoP50637 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TspoP50637 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TspoP50637 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TspoP50637 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TspoP50637 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TspoP50637 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TspoP50637 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TspoP50637 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TspoP50637 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TspoP50637 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TspoP50637 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TspoP50637 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TspoP50637 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TspoP50637 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TspoP50637 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TspoP50637 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TspoP50637 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TspoP50637 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TspoP50637 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TspoP50637 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TspoP50637 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TspoP50637 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TspoP50637 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TspoP50637 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TspoP50637 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TspoP50637 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TspoP50637 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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