Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SftpdP50404 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SftpdP50404 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SftpdP50404 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SftpdP50404 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SftpdP50404 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SftpdP50404 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SftpdP50404 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SftpdP50404 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms