Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtpreP49446 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtpreP49446 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PtpreP49446 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtpreP49446 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtpreP49446 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtpreP49446 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtpreP49446 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PtpreP49446 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtpreP49446 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PtpreP49446 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PtpreP49446 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PtpreP49446 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtpreP49446 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PtpreP49446 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtpreP49446 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtpreP49446 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtpreP49446 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms