Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epb42P49222 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epb42P49222 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epb42P49222 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Epb42P49222 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epb42P49222 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epb42P49222 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epb42P49222 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epb42P49222 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epb42P49222 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms