Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rbp3P49194 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rbp3P49194 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbp3P49194 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms