Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prox1P48437 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prox1P48437 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prox1P48437 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prox1P48437 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms