Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rfx1P48377 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms