Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms