Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdc2P43407 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sdc2P43407 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Sdc2P43407 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sdc2P43407 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sdc2P43407 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sdc2P43407 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sdc2P43407 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sdc2P43407 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sdc2P43407 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sdc2P43407 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sdc2P43407 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sdc2P43407 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sdc2P43407 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sdc2P43407 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sdc2P43407 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sdc2P43407 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sdc2P43407 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sdc2P43407 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sdc2P43407 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sdc2P43407 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sdc2P43407 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sdc2P43407 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sdc2P43407 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sdc2P43407 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sdc2P43407 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sdc2P43407 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sdc2P43407 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sdc2P43407 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sdc2P43407 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sdc2P43407 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sdc2P43407 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sdc2P43407 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sdc2P43407 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sdc2P43407 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sdc2P43407 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sdc2P43407 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sdc2P43407 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sdc2P43407 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sdc2P43407 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdc2P43407 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdc2P43407 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdc2P43407 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdc2P43407 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdc2P43407 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sdc2P43407 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sdc2P43407 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sdc2P43407 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sdc2P43407 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdc2P43407 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdc2P43407 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdc2P43407 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdc2P43407 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdc2P43407 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sdc2P43407 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sdc2P43407 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sdc2P43407 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sdc2P43407 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sdc2P43407 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sdc2P43407 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sdc2P43407 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sdc2P43407 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sdc2P43407 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sdc2P43407 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sdc2P43407 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sdc2P43407 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sdc2P43407 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sdc2P43407 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sdc2P43407 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sdc2P43407 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sdc2P43407 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sdc2P43407 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sdc2P43407 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sdc2P43407 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sdc2P43407 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sdc2P43407 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sdc2P43407 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sdc2P43407 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sdc2P43407 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sdc2P43407 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sdc2P43407 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdc2P43407 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdc2P43407 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdc2P43407 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdc2P43407 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdc2P43407 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdc2P43407 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdc2P43407 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdc2P43407 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdc2P43407 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdc2P43407 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdc2P43407 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdc2P43407 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdc2P43407 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdc2P43407 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdc2P43407 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdc2P43407 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sdc2P43407 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms