Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgavP43406 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgavP43406 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgavP43406 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ItgavP43406 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ItgavP43406 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ItgavP43406 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgavP43406 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgavP43406 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgavP43406 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ItgavP43406 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ItgavP43406 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ItgavP43406 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms