Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtgfrP43117 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtgfrP43117 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtgfrP43117 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PtgfrP43117 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtgfrP43117 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtgfrP43117 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtgfrP43117 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtgfrP43117 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtgfrP43117 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtgfrP43117 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtgfrP43117 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms