Protein–RNA interactions for Protein: P43024

Cox6a1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6a1P43024 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Cox6a1P43024 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox6a1P43024 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms