Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LtbP41155 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LtbP41155 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LtbP41155 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LtbP41155 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LtbP41155 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LtbP41155 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LtbP41155 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LtbP41155 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LtbP41155 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LtbP41155 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LtbP41155 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LtbP41155 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LtbP41155 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LtbP41155 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LtbP41155 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LtbP41155 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LtbP41155 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LtbP41155 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LtbP41155 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LtbP41155 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LtbP41155 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LtbP41155 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LtbP41155 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LtbP41155 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LtbP41155 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LtbP41155 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LtbP41155 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LtbP41155 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LtbP41155 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LtbP41155 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LtbP41155 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LtbP41155 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LtbP41155 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LtbP41155 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LtbP41155 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LtbP41155 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LtbP41155 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LtbP41155 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LtbP41155 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LtbP41155 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LtbP41155 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LtbP41155 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LtbP41155 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LtbP41155 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LtbP41155 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LtbP41155 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LtbP41155 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LtbP41155 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LtbP41155 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LtbP41155 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LtbP41155 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LtbP41155 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LtbP41155 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LtbP41155 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LtbP41155 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LtbP41155 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LtbP41155 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LtbP41155 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LtbP41155 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LtbP41155 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LtbP41155 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LtbP41155 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LtbP41155 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LtbP41155 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LtbP41155 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LtbP41155 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LtbP41155 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LtbP41155 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbP41155 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbP41155 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbP41155 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbP41155 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbP41155 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbP41155 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbP41155 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbP41155 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbP41155 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbP41155 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbP41155 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbP41155 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbP41155 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbP41155 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbP41155 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbP41155 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbP41155 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbP41155 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbP41155 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbP41155 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbP41155 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbP41155 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbP41155 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbP41155 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbP41155 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbP41155 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbP41155 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbP41155 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbP41155 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbP41155 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbP41155 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms