Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
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