Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timp3P39876 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timp3P39876 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timp3P39876 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timp3P39876 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp3P39876 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp3P39876 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp3P39876 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timp3P39876 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms