Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ddit3P35639 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms