Protein–RNA interactions for Protein: P35545

Fau, Ubiquitin-like protein FUBI, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FauP35545 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FauP35545 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FauP35545 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FauP35545 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FauP35545 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FauP35545 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FauP35545 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FauP35545 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FauP35545 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FauP35545 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FauP35545 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FauP35545 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FauP35545 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FauP35545 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FauP35545 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FauP35545 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FauP35545 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FauP35545 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FauP35545 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FauP35545 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FauP35545 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FauP35545 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FauP35545 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FauP35545 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FauP35545 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FauP35545 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FauP35545 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FauP35545 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FauP35545 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FauP35545 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FauP35545 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FauP35545 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FauP35545 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FauP35545 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FauP35545 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FauP35545 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FauP35545 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FauP35545 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FauP35545 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FauP35545 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FauP35545 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FauP35545 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FauP35545 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FauP35545 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FauP35545 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FauP35545 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FauP35545 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FauP35545 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FauP35545 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FauP35545 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FauP35545 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FauP35545 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FauP35545 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FauP35545 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FauP35545 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FauP35545 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FauP35545 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FauP35545 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FauP35545 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FauP35545 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FauP35545 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FauP35545 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FauP35545 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FauP35545 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FauP35545 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FauP35545 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FauP35545 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FauP35545 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FauP35545 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FauP35545 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FauP35545 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FauP35545 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FauP35545 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FauP35545 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FauP35545 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FauP35545 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FauP35545 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FauP35545 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FauP35545 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FauP35545 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FauP35545 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FauP35545 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FauP35545 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FauP35545 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FauP35545 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FauP35545 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FauP35545 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FauP35545 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FauP35545 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FauP35545 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FauP35545 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FauP35545 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FauP35545 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FauP35545 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FauP35545 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FauP35545 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FauP35545 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FauP35545 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FauP35545 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FauP35545 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms