Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd22P35329 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd22P35329 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd22P35329 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd22P35329 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd22P35329 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd22P35329 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd22P35329 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cd22P35329 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms