Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab21P35282 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab21P35282 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rab21P35282 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab21P35282 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab21P35282 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab21P35282 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms