Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxc10P31257 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc10P31257 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms