Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxa2P31245 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms