Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd28P31041 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd28P31041 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd28P31041 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd28P31041 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd28P31041 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd28P31041 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd28P31041 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd28P31041 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd28P31041 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd28P31041 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms