Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnd3P30282 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnd3P30282 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms