Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msr1P30204 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msr1P30204 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Msr1P30204 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msr1P30204 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Msr1P30204 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msr1P30204 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msr1P30204 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msr1P30204 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msr1P30204 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms